Carlos Cuarón estudió letras inglesas en la UNAM. Participó en el taller de narrativa de Hernán Lara Zavala, el taller de guión de Syd Field y en el Laboratorio de Guionistas del Sundance Institute en dos ocasiones distintas.Cuarón escribió algunas obras de teatro como "Llantas contra el pavimento", "Zapatos y alpargatas, Puro y natural" , y "Coco Tuétano y la rebelión de las armas".Junto con su hermano Alfonso, Carlos Cuarón escribió el guion de la película "Y tu mamá también", que recibió el León de Plata del Festival de Venecia al Mejor Guión, y fue nominado en los premios BAFTA del Reino Unido y al Óscar de la Academia de Ciencias y Artes Cinematográficas de Estados Unidos por Mejor Guión Original.Carlos Cuarón escribió el guion de "Sólo con tu pareja", dirigida por su hermano Alfonso, ganador del Ariel al Mejor Argumento en 1992.Fue editor, guionista y director de los cortometrajes "No me digan Hugo", "Amor perdido", "Amor al tri", "Juego de niños", "Me la debes", "Noche de bodas", seleccionada para la Semana Internacional de la Crítica del Festival de Cannes en 2001, "Mamacita" y "Sístole/Diástole".En 2007 Carlos Cuarón participó en la mesa redonda "Futbolistas que escriben y escritores que futboleanCarlos Cuarón dirigió la película Rudo y Cursi, un proyecto de Cha Cha Cha Films en 2008. En el film participaron Diego Luna, Gael Garcia Bernal, Guillermo Francella e Ivan Esquivel. Rudo y cursi de Carlos Cuarón, se convertió en la primer película producida en conjunto por Alfonso Cuarón, Guillermo del Toro y Alejandro González Iñárritu.